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基于RNA-seq识别布鲁菌酸调控候选基因
基于RNA-seq识别布鲁菌酸调控候选基因
作者:
何玉华
刘倩宏
刘星宇
闫峰
魏杰
原文服务方:
中国兽医杂志
布鲁菌
转录组
RNA-seq
酸压力
摘要:
布鲁菌作为胞内寄生菌,在胞内生存面临很多压力.特别是感染早期,胞内的酸化是布鲁菌生存的必要条件.本试验利用RNA-seq,对正常培养条件、酸性培养条件的布鲁菌进行比较转录组学分析.结果表明,在酸性条件下113个基因表达发生显著变化(|logRatio|≥3),其中44%表达上调.经pathway分析,差异基因分布在51个通路,其中与布鲁菌胞内生存及毒力相关的通路有6个,分别是氧化磷酸化、离子转运、细菌分泌系统、转录调节系统、二元转运调控系统和ABC转运系统.布鲁菌对于酸性生存环境表现多通路、多基因的适应性变化,该研究为系统掌握酸调节基因奠定基础.
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差异表达基因
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内容分析
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文献信息
篇名
基于RNA-seq识别布鲁菌酸调控候选基因
来源期刊
中国兽医杂志
学科
关键词
布鲁菌
转录组
RNA-seq
酸压力
年,卷(期)
2016,(1)
所属期刊栏目
实验观察
研究方向
页码范围
34-37
页数
4页
分类号
S852.61
字数
语种
中文
DOI
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作者信息
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姓名
单位
发文数
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G指数
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刘星宇
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节点文献
布鲁菌
转录组
RNA-seq
酸压力
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国兽医杂志
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0529-6005
CN:
11-2471/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1953-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
12894
总下载数(次)
0
总被引数(次)
54031
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