基于生物信息学探讨Yes-相关蛋白在大鼠心肌缺血再灌注损伤中的表达

• 作者: 李林芳 李绍兰 胡迎春 钟武 陈睦虎
• 来源期刊: 华西医学
• 关键词: 心肌缺血再灌注损伤 HIPPO通路 Yes-相关蛋白 生物信息学 大鼠
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 互联互通,共享发展
• 页码范围: 1008-1012
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.7507/1002-0179.201600272

摘要

目的 验证通过生物信息学技术筛选出Yes-相关蛋白(YAP)在大鼠心肌缺血再灌注损伤中的表达情况,为后期进一步研究奠定基础.方法 利用生物信息学技术分析大鼠心肌缺血再灌注损伤的差异基因,应用KOBAS2.0以及KEGG数据库筛选出相关的信号通路和关键基因.将18只Sprague Dawley大鼠随机分配为正常组(n=6)、假手术组(n=6)、缺血再灌注损伤组(模型组,n=6),采用免疫组织化学、逆转录荧光定量聚合酶链反应、蛋白质印迹法检测筛选出的靶基因的表达情况.结果 通过生物信息学技术筛选出差异表达基因共345条,上调181条,下调164条;筛选出的差异基因主要富集于Wnt、HIPPO、MAKP、Jak-STAT等信号通路;该课题组关注HIPPO信号通路,发现与正常组和假手术组比较,模型组中其关键蛋白YAP在基因以及蛋白表达水平增加,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 经生物信息学筛选出来的HIPPO信号通路关键蛋白YAP在大鼠心肌缺血再灌注损伤中表达增加.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟武	西南医科大学附属医院	21	47	4.0	6.0
2	陈睦虎	西南医科大学附属医院	14	22	3.0	3.0
3	李绍兰	西南医科大学附属医院	2	0	0.0	0.0
4	李林芳	西南医科大学附属医院	3	0	0.0	0.0
5	胡迎春	西南医科大学附属医院	8	6	1.0	2.0