梅花鹿致敏与休眠鹿茸干细胞差异蛋白表达的2D-DIGE分析

• 作者: 刘振 孙红梅 李春义 王权威 董振
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鹿茸干细胞 再生 蛋白质组学 2D-DIGE
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 92-104
• 页数: 13页
• 分类号: S825|S813.3
• 字数: 8412字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.01.013

摘要

旨在对梅花鹿(Cervus nippon)致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞表达蛋白进行差异筛选、鉴定及生物信息分析,为深入探讨鹿茸独特的再生分子调节机制奠定基础.本研究采用双向荧光差异凝胶电泳(Two-dimensional fluorescence difference in gel electrophoresis,2D-DIGE)分离蛋白样品;利用DeCyder 7.2分析软件对2D-DIGE图像进行统计学分析寻找差异表达蛋白;利用MALDI-TOF-MS (Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight tandem mass spectrometry)鉴定差异蛋白,通过Mascot软件搜索NCBInr数据库寻找匹配的蛋白;采用PANTHER (Protein Analysis Through Evolutionary Relationships)软件对差异蛋白进行聚类分析,REACTOME数据库分析差异蛋白所参与的信号通路.结果得到了致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞2D-DIGE图谱,致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞蛋白丰度相比较,比值≥1.1倍以及比值≤-1.1倍(P＜0.05)的差异蛋白点有159个,其中110个上调表达,49个下调表达,EDA(Extended data analysis)分析得到了多个Marker蛋白,质谱鉴定了84个差异蛋白质点,48个为阳性结果,共来自27种蛋白质.并对已鉴定蛋白进行了GO分析以及信号通路富集分析.致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞蛋白差异明显,质谱鉴定获得了来自多种可能与鹿茸再生相关的差异蛋白.由此可知,鹿茸再生是鹿茸干细胞从休眠到致敏的转化过程,需要多种蛋白分子以及信号通路的综合调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙红梅	中国农业科学院特产研究所特种动物分子生物学国家重点实验室	23	96	5.0	9.0
2	李春义	中国农业科学院特产研究所特种动物分子生物学国家重点实验室	54	144	6.0	9.0
3	刘振	中国农业科学院特产研究所特种动物分子生物学国家重点实验室	10	33	4.0	5.0
4	王权威	中国农业科学院特产研究所特种动物分子生物学国家重点实验室	4	10	2.0	3.0
5	董振	中国农业科学院特产研究所特种动物分子生物学国家重点实验室	3	9	2.0	3.0