不同光周期条件下日本牙鲆尾部神经分泌系统转录组分析

• 作者: 吕为群 张影 陈松林 陈阿琴
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 日本牙鲆 尾部神经分泌系统 光周期 转录组
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 页码范围: 833-843
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20151010134

摘要

为发掘日本牙鲆响应光周期变化的重要功能基因,采用新一代高通量测序RNA-seq技术分析8L∶ 16D、12L∶ 12D和16L∶ 8D等3个光周期条件下日本牙鲆尾部神经分泌系统(caudal neurosecretory system,CNSS)的基因表达变化.转录组测序结果显示,3个样品分别产生了5 807 622、6 147 140和6 116 872个Clean reads.分别对8L∶16D、12L∶ 12D和16L∶8D条件下的文库进行两两比较,共获得200个差异表达基因.GO分类分析表明,差异表达基因属于生物学过程、细胞定位和分子功能的42个类别.KEGG Pathway显著性富集分析差异表达基因共涉及29条代谢途径,包括糖酵解/糖异生、钙离子信号转导、血管平滑肌收缩和光信号转导等通路.上述结果不仅加深了对鱼类尾部神经分泌系统功能的认识,也为进一步探索硬骨鱼类光信号转导机制提供了多方面多层次的信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈松林	中国水产科学研究院黄海水产研究所	65	1094	20.0	30.0
2	吕为群	上海海洋大学水产与生命学院	60	329	9.0	15.0
3	陈阿琴	上海海洋大学水产与生命学院	27	85	5.0	7.0
4	张影	上海海洋大学水产与生命学院	3	6	1.0	2.0