苹果全基因组多聚半乳糖醛酸酶基因家族的鉴定及进化分析

• 作者: 张东 樊胜 邵红霞 陈鸿飞 韩明玉 马娟娟
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 PG 家族分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 1863-1877
• 分类号: S666.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0224

摘要

从苹果全基因组中鉴定出85个多聚半乳糖醛酸酶(PG)基因,通过聚类分析将其分成了7个组(GroupA ～ Group G),其分子量在176～1 125aa之间,等电点在4.68～9.58之间.鉴定出来的MdPG基因除在14号染色体没有分布外,其余都有分布.系统分析了MdPG蛋白的保守基序和MdPG基因结构,发现苹果PG蛋白除包含有广泛存在于各种PG蛋白的4个保守基序以外,还含有其他相对特异的保守基序,MdPG75具有最多的外显子数,达到18个.对85个苹果PG蛋白之间的功能联系网络进行了系统研究,分析预测了相关基因的功能和多个基因间功能的联系,并作了初步验证.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张东	西北农林科技大学园艺学院	31	238	10.0	14.0
2	韩明玉	西北农林科技大学园艺学院	260	3736	32.0	45.0
3	樊胜	西北农林科技大学园艺学院	9	67	5.0	8.0
4	马娟娟	西北农林科技大学园艺学院	12	87	6.0	9.0
5	邵红霞	西北农林科技大学园艺学院	3	24	3.0	3.0
6	陈鸿飞	西北农林科技大学园艺学院	2	13	2.0	2.0