用于羊草基因分型的 SNP 分子标记技术研究

• 作者: 侯莉娟 刘公社 陈双燕 齐冬梅 齐晓
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 羊草 转录组 SNP 标记 HRM 基因分型 指纹图谱
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 105-113
• 页数: 9页
• 字数: 5672字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb2015466

摘要

以我国广泛分布的多年生优势禾本科牧草羊草为研究材料，针对羊草目前尚无 SNP 标记技术的报道，基于实验室已有的转录组数据，挖掘其中的 SNP 分子标记，建立一种利用高分辨率熔解曲线（high-resolution melting， HRM）进行羊草 SNP 基因分型的方法。结果表明，从羊草转录组数据中获得41843个 SNPs，转换的数量是颠换数量的2倍；建立了基于 SNP 的 HRM 基因分型方法，设计了112对 SNP 引物，其中有98对（87．5％）能扩增出明亮单一条带，扩增条带大小符合预期的有72对（64．29％），适宜进行 HRM 基因分型的引物有46对，占41．07％；用其中的7对引物可将羊草48份种质区分开，并绘制出指纹图谱。通过对部分 HRM 基因分型结果进行测序验证，表明测序分析的基因型结果与 HRM 基因分型结果一致，证明 HRM 基因分型结果是可靠的。本研究首次建立的基于 SNP 的 HRM 基因分型方法，可用于羊草种质资源的指纹图谱绘制、育种亲本的选配、基因关联分析、分子标记辅助育种、功能分子标记开发、新品种的保护等育种工作。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈双燕	中国科学院植物研究所北方资源植物重点实验室	10	227	6.0	10.0
2	刘公社	中国科学院植物研究所北方资源植物重点实验室	49	1310	21.0	35.0
3	齐冬梅	中国科学院植物研究所北方资源植物重点实验室	20	699	14.0	20.0
4	齐晓	中国农业科学院草原研究所	8	188	6.0	8.0
8	侯莉娟	中国科学院植物研究所北方资源植物重点实验室	1	12	1.0	1.0