α-tubulin基因的克隆、生物信息学分析及其在仿刺参肠道再生过程中的表达模式

• 作者: 常亚青 张向向 杨立猛 湛垚垚 王怡 高银雪
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 仿刺参 α-微管蛋白 克隆 生物信息学分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 页码范围: 547-557
• 分类号: Q785|S917.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20150910083

摘要

为了明确仿刺参α-微管蛋白(α-tubulin)基因的序列及结构信息,初步研究该基因在仿刺参肠道再生过程中的生物学功能,本研究利用转录组数据挖掘和cDNA末端快速扩增技术(RACE)首次克隆得到仿刺参α-tubulin基因的全长cDNA序列.结果表明,仿刺参α-tubulin基因cDNA全长为1641 bp,共编码453个氨基酸,经生物信息学分析发现,该基因的5'端非编码区为153 bp,3'端非编码区为126 bp,推算该基因所编码的蛋白质分子量为50.33 ku,等电点为4.89,属于亲水性非跨膜蛋白质,且氨基酸序列中含有微管蛋白特有的信号序列GGGTGSG.通过与13种已公布物种的α-tubulin氨基酸序列进行多重序列比对及系统进化分析,发现仿刺参α-tubulin蛋白的氨基酸序列与其他真核生物的α-tubulin蛋白序列具有非常高的保守性,与南极岩斑鳕α-tubulin相似性高达90％.采用实时定量PCR技术对α-tubulin基因在仿刺参肠组织再生不同时期的表达情况进行检测,结果显示α-tubulin基因在仿刺参肠组织再生不同时期均有表达,其相对表达量在肠组织再生17d时最高,5d时最低.本研究在获得仿刺参α-tubulin基因结构信息的同时,进一步印证了真核生物α-tubulin基因的高度保守性,同时表明α-tubulin基因参与仿刺参肠道再生过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常亚青	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	142	766	15.0	19.0
2	高银雪	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	6	30	3.0	5.0
3	王怡	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	3	2	1.0	1.0
4	湛垚垚	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	19	34	3.0	5.0
5	张向向	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	1	0	0.0	0.0
6	杨立猛	大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室	1	0	0.0	0.0