江苏省2015年柯萨奇病毒A组16型VP1基因特征

• 作者: 单军 姚萍 嵇红 李琼 樊欢 王凤鸣 黎俊宏
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 柯萨奇病毒A组16型 VP1 B1
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 手足口病研究专题论著
• 页码范围: 689-693
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文

摘要

分析江苏省2015年柯萨奇病毒A组16型(CA16)分离株VP1基因特征.对江苏省2015年分离得到的20株CA16毒株进行VP1区基因扩增和扩增产物测序,并应用Mega 6.0和DNA Star软件对其构建基因进化树并分析核苷酸和氨基酸同源性.20株CA16分离株VP1核苷酸和氨基酸同源性分别为88.2％～100.0％和98.0％～100.0％;与A型国际原型株G10核苷酸和氨基酸同源性分别为75.3％～77.4％和90.6％～92.3％;与B1型代表株核苷酸和氨基酸同源性分别为88.3％～98.4％和96.3％～100.0％;与B2型代表株核苷酸和氨基酸同源性分别为88.4％～90.8％和96.6％～100.0％.20株CA16分离株基因亚型均为B1型,其中19株为B1b型,1株为B1a型,并有1个B1b传播链.江苏省2015年CA16分离株属于B1基因亚型,存在B1a和B1b两个进化分支共同进化和循环,其中以B1b为绝对优势流行株.