类风湿关节炎患者外周血环状RNA表达谱研究

• 作者: 宋新强 张丽丽 曾宪思 汪学群 王磊 赵仕琪 陈磊
• 来源期刊: 中华风湿病学杂志
• 关键词: 关节炎,类风湿 靶基因 生物信息学 环状RNA
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 541-546,前插1
• 页数: 7页
• 字数: 3329字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-7480.2016.08.008

摘要

目的 筛选RA患者外周血中差异性表达的环状RNA(circRNA)并进行生物信息学分析,以探讨外周血circRNA在RA发病中的作用.方法 采用circRNA芯片对3例RA患者和3名健康对照的外周血中的circRNA进行筛查,用R软件包对数据进行归一化及后续数据处理,通过Fold Change和P值进行筛选,采用t检验,寻找2组样本间差异表达的circRNA,并对差异表达的circRNA进行生物信息学分析.结果 芯片筛查结果提示有36个circRNA在RA组和对照组之间差异有统计学意义,14个circRNA下调,22个circRNA上调.对这些circRNA所涉及的基因进行基因本体论(GO)分析,结果提示,这些基因主要参与生物学调控、细胞分化、代谢过程等.对每个差异表达的circRNA的靶miRNA进行预测,其中有1个circRNA(hsa circ 0005397)预测结果中有1个miRNA (hsa-miR-125a-3p)在文献中得到验证,用Cytoscape软件对三者之间的网络关系进行了预测.结论 RA患者外周血中的circRNA出现多个差异性表达,circRNA可能参与RA调控机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汪学群	河南省信阳市第一人民医院风湿免疫科	8	40	3.0	6.0