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2010-2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况
2010-2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况
作者:
刘洁
叶力
周波
李汶蔚
梁冰玉
梁浩
王敏连
王洪
蒋俊俊
赵芳凝
陈荣风
黄颉刚
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
HIV-1
基因
感染
重组毒株
摘要:
目的:分析广西壮族自治区(广西)HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况。方法于2010年1月1日至2012年12月31日,采用方便抽样的方法,在广西11个城市开展调查,通过问卷调查收集调查对象的流行病学资料。纳入标准为:Western blot确证HIV-1阳性、病毒载量>1000拷贝/ml、>18岁及无特殊重大疾病。共招募到调查对象152例。采集每例调查对象5 ml外周血并提取病毒基因组RNA,采用巢式RT-PCR扩增病毒pol区全长基因并测序;对所得序列修正后用Genotyping进行初步分型;采用MEGA 5.03软件构建系统进化树对pol序列分型进行验证;采用RIP及jpHMM at GOBICS程序分析未知重组毒株的重组断点。结果152例HIV-1感染者共成功扩增出137例pol区全长基因,共获得127例HIV-1亚型判定,其中CRF01_AE占55.9%(71例),CRF08_BC占29.9%(38例), CRF07_BC占10.2%(13例),B(B')占2.4%(3例),未知重组型占1.6%(2例)。广西11个城市以CRF01_AE亚型流行为主;异性性传播和注射毒品传播感染HIV-1者间CRF01_AE亚型分布差异有统计学意义(χ2=15.07,P<0.001),其比例分别为67.4%(58/86)和34.1%(14/41);21~35、36~60和>60岁HIV-1感染者中,CRF01_AE亚型所占比例分别为43.6%(17/39)、57.6%(38/66)、77.3%(17/22), CRF_08BC亚型所占比例分别为43.6%(17/39)、28.8%(19/66)、9.1%(2/22),差异有统计学意义(χ2=8.48,P=0.014)。2株未知重组型毒株的模式分别为CRF01_AE/B(B')和CRF01_AE/C/B(B')重组型。结论2010—2012年广西HIV-1流行株pol基因主要流行亚型为CRF01_AE,以异性性传播为主;出现的未知重组型毒株是由CRF01_AE与CRF_BC重组产生的。
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文献信息
篇名
2010-2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况
来源期刊
中华预防医学杂志
学科
关键词
HIV-1
基因
感染
重组毒株
年,卷(期)
2016,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
79-84
页数
6页
分类号
字数
3098字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2016.01.014
五维指标
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重组毒株
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中华预防医学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-9624
CN:
11-2150/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-61
创刊时间:
1953
语种:
chi
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