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基于表达谱芯片挖掘清远麻鸡和科宝肉鸡比目鱼肌差异表达基因
基于表达谱芯片挖掘清远麻鸡和科宝肉鸡比目鱼肌差异表达基因
作者:
单艳菊
宋卫涛
宋迟
徐文娟
李慧芳
束婧婷
章明
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肌纤维性状
表达谱芯片
差异表达基因
清远麻鸡
科宝肉鸡
摘要:
对生长速度长期的高压选择导致了快大型肉鸡与优质型地方鸡显著的表型差异,本研究旨在研究这种表型差异的分子遗传机理.采用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对达到性成熟的优质型清远麻鸡(112 d)和快大型科宝肉鸡(42 d)比目鱼肌中与肌纤维发育和类型组成相关的候选基因及信号通路进行系统筛查.结果,芯片分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因1 318个,以科宝肉鸡作为参照,清远麻鸡中上调基因501个,下调基因817个,主要涉及到肌肉发育、能量代谢、脂质代谢等生物学过程.基于KEGG Pathway分析发现,差异基因除了参与肌纤维发育和分化相关信号通路(如Hedgehog信号通路和Ca2+信号通路)外,Wnt信号通路,mTOR信号通路,MAPK信号通路,ErbB信号通路、JAK-STAT信号通路等一些跟能量代谢相关的信号通路也被富集为显著的信号通路.与能量代谢相关的信号通路和与肌肉发育相关的信号通路相互作用形成一个调控网络从而影响肌纤维的发育,筛选出了20个在肌纤维生长发育及分化过程中可能具有重要影响的候选基因,但这些差异表达基因在肌纤维的发育和分化过程中的作用尚待深入研究.
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文献信息
引文网络
相关学者/机构
相关基金
期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
基于表达谱芯片挖掘清远麻鸡和科宝肉鸡比目鱼肌差异表达基因
来源期刊
畜牧兽医学报
学科
农学
关键词
肌纤维性状
表达谱芯片
差异表达基因
清远麻鸡
科宝肉鸡
年,卷(期)
2016,(1)
所属期刊栏目
遗传繁育
研究方向
页码范围
25-33
页数
9页
分类号
S813.2
字数
6118字
语种
中文
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2016.01.004
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李慧芳
112
611
10.0
21.0
2
徐文娟
74
184
7.0
8.0
3
宋卫涛
75
185
7.0
8.0
4
宋迟
48
169
7.0
9.0
5
束婧婷
43
139
7.0
9.0
6
单艳菊
43
147
7.0
9.0
7
章明
21
40
3.0
6.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
(20)
节点文献
引证文献
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同被引文献
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二级引证文献
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引证文献(2)
二级引证文献(0)
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引证文献(2)
二级引证文献(0)
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引证文献(0)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
肌纤维性状
表达谱芯片
差异表达基因
清远麻鸡
科宝肉鸡
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0366-6964
CN:
11-1985/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号
邮发代号:
82-453
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
5501
总下载数(次)
6
总被引数(次)
62883
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
江苏省自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Jiangsu Province
官方网址:
http://www.jsnsf.gov.cn/News.aspx?a=37
项目类型:
学科类型:
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