辣椒 EST-SSR 标记的开发与验证

• 作者: 康建坂 李永平 林珲 温庆放
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 EST-SSR 标记开发 指纹图谱
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 1187-1192
• 页数: 6页
• 分类号: S641.3
• 字数: 4178字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.11.009

摘要

从 NCBI 数据库下载118900条辣椒相关 EST,对其进行 SSR 位点搜索,共搜索出3343条 SSR,分布密度为1/17.20 kb,共有287种重复基元。在辣椒 EST-SSR 中,二核苷酸(1476个 SSR)和六核苷酸(1128个 SSR)占主导地位,所占比例分别为44.15%和33.74%；出现最多的重复基元是 GA/TC,占总数的14.30%,其次为 CT/AG (94个,占8.11%)。针对3343条含有 SSR 的 EST 设计合成了200对引物。用17份辣椒种质对200对引物进行筛选,196对引物有扩增产物,71对引物表现出多态性,共有220个多态性位点。利用71对多态性引物,对特定亲本 P181-2-6和 P230-2-5及其杂种一代 F1的亲缘关系进行检测,结果说明从辣椒相关 EST 数据库中开发的 SSR 引物有较好的可用性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	康建坂	福建省农业科学院蔬菜研究中心	39	257	10.0	14.0
5	李永平	福建省农业科学院蔬菜研究中心	64	330	11.0	15.0
9	温庆放	福建省农业科学院蔬菜研究中心	108	864	14.0	25.0
13	林珲	福建省农业科学院蔬菜研究中心	33	137	8.0	11.0