新疆艾比湖沉积物中免培养放线菌的多样性

• 作者: 吕光辉 吕杰 马媛
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 盐湖 艾比湖 放线菌 多样性
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1426-1433
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wswxb.20150554

摘要

[目的]采用免培养的方法研究新疆艾比湖湖底沉积物放线菌组成及多样性.[方法]采集并混合5份艾比湖湖底沉积物样本,并提取其总DNA,采用放线菌通用引物对其16S rRNA基因序列进行Touchdown PCR,构建放线菌16S rRNA基因文库.蓝白斑筛选后随机挑选白色克隆分析,利用限制性内切酶HhaⅠ进行酶切分型,挑选具有独特限制性片段差异的阳性克隆进行测序分析.序列经Chimera Check检测,BLAST同源比对及构建16S rRNA基因序列系统发育树.[结果]随机挑选192个白色克隆,其中166个为阳性克隆,选取51个具有独特限制性片段差异的克隆进行序列分析.测序结果进行比对以及Chimera Check检测后,共获得36个可操作单元(Operational Taxonomic Units,OTUs),GenBank注册号为KR182090-KR182131.文库覆盖度结果表明克隆文库涵盖了本环境中90.4％的放线菌类群.聚类结果显示,艾比湖湖底沉积物中放线菌分为2个类群,第1个类群属于放线菌门(Actinobacteria),放线菌纲(Actinobacteria)中的放线菌目(Actinomycetales)、丙酸杆菌目(Propionibacteriales)、微球菌目(Micrococcales)和棒杆菌目(Corynebacteriales)4个目,该类群占克隆文库1 8.1％;另外1个类群属于Unclassified Actinobacteria的类群,分为3个不同的group,占整个克隆文库的81.9％.[结论]新疆艾比湖湖底沉积物中存在多种未知的放线菌类群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕杰	新疆大学资源与环境科学学院	45	474	13.0	20.0
3	马媛	新疆大学资源与环境科学学院	26	180	6.0	12.0
7	吕光辉	新疆大学资源与环境科学学院	120	1582	21.0	32.0