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摘要:
限制性酶切位点关联DNA测序技术(restriction-site-associated DNA sequencing,RAD-seq)是在二代测序技术基础上发展起来的一种简化基因组技术(reduced-representation genome sequencing,RRGS).RAD-seq利用限性核酸内切酶使基因组片段化,经过修饰后连接含标记的接头构建文库并进行测序.因其具有操作简单、实验成本低、通量高等优点,在分子生态学、进化基因组学、保护遗传学等领域得到应用.目前发展起来的RAD-seq技术主要包括利用稀有酶和物理打断方式进行基因组片段化的mbRAD、利用稀有酶和常见酶组合酶切的方式进行基因组片段化的ddRAD、利用IIB型限制性内切酶得到短片段文库的2bRAD、利用同裂酶和Illumina试剂盒建库的ezRAD和完全利用Nextera试剂盒建库的nextRAD.本文对每种RAD-seq技术的特点及其在昆虫种群遗传学、群落生态学、物种界定、系统发育和遗传连锁图谱构建等研究领域的应用进行了综述.
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文献信息
篇名 RAD-seq技术及其在昆虫学研究中的应用
来源期刊 昆虫学报 学科 生物学
关键词 RAD-seq 昆虫学 种群遗传学 物种界定 系统发育 遗传连锁图谱
年,卷(期) 2016,(7) 所属期刊栏目 综述
研究方向 页码范围 767-774
页数 分类号 Q966
字数 语种 中文
DOI 10.16380/j.kcxb.2016.07.009
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 朱家颖 西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室 33 179 7.0 12.0
2 魏书军 北京市农林科学院植物保护环境保护研究所 53 434 12.0 17.0
3 曹利军 北京市农林科学院植物保护环境保护研究所 8 20 3.0 4.0
4 李冰艳 北京市农林科学院植物保护环境保护研究所 1 7 1.0 1.0
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RAD-seq
昆虫学
种群遗传学
物种界定
系统发育
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