PRRSV 广西分离株 GXYL-1403全基因克隆与序列分析

• 作者: 林思远 洪绍锋 陈樱 韦祖樟 韦莹 黄伟坚 黄加滨
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 克隆 序列分析 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 44-49
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6|Q785
• 字数: 3608字
• 语种: 中文

摘要

对本实验室所分离的1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)毒株 GXYL-1403进行全基因组克隆和序列分析。参考已发表的扩增全长 PRRSV 序列的13对特异性引物,用 RT-PCR 方法对病毒基因组进行分段扩增。将扩增得到的 PCR 片段克隆到 pMD18-T 载体上,获得的重组质粒经 PCR 鉴定后进行序列测定。通过软件对所扩增序列进行拼接,获得 GXYL-1403的全长序列,并对 GXYL-1403进行比较和遗传进化分析。结果表明 GXYL1403株基因序列全长为15018 bp,与国内外多株 PRRSV 毒株进行同源性比较发现,与 VR-2332的相似性为89．1％,与 TJ、JXA1、HEB1、HUB1、HUB2、TP 株同源性达到了97．9％~98．1％。另外,GXYL-1403分离株 nsp2蛋白含有高致病性 PRRSV 特异的1＋29个氨基酸的缺失。特别重要的是,在缺失29个氨基酸区域的上游,含有连续20个氨基酸缺失,在下游出现了连续74个氨基酸的缺失。遗传进化分析发现美洲型 PRRSV 主要分为3个亚群,GXYL-1403跟高致病性 PRRSV 毒株属于同一分支,证实了 GXYL-1403株为美洲型 PRRSV 毒株。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄伟坚	广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室	72	351	11.0	15.0
2	林思远	广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室	2	15	2.0	2.0
3	洪绍锋	广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室	3	21	3.0	3.0
4	黄加滨	广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室	2	15	2.0	2.0
5	韦莹	广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室	5	43	4.0	5.0
6	陈樱	广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室	22	45	4.0	6.0