应用iTRAQ定量蛋白质组学研究海分枝杆菌mkl的基因功能

• 作者: 施旭骏 牛辰 赵超 高谦
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 分枝杆菌 定量蛋白质组学 iTRAQ mkl基因
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1496-1503
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20150593

摘要

[目的]通过分离海分枝杆菌野生株和mkl突变株的全菌蛋白,并进行差异蛋白质组分析,以期为探索分枝杆菌重要毒力基因mkl的功能提供新思路.[方法]以海分枝杆菌野生株和mkl突变株为研究材料,提取全菌蛋白,iTRAQ试剂标记后进行质谱鉴定和定量分析,并利用UniProt数据库对差异蛋白进行生物信息学分析.[结果]共鉴定出在野生株和mkl突变株中差异表达蛋白566个,其中在突变株中上调表达蛋白232个(比值≥1.4),下调表达蛋白334个(比值≤0.7).生物信息学预测这些蛋白主要参与细菌脂质代谢、细胞壁和细胞进程、中间代谢、呼吸作用等生物学功能.其中DesA3下调最显著,其功能为脂肪酸去饱和酶,与油酸合成相关,进一步验证发现mkl突变株在不含油酸的固体培养基中生长受限,提示mkl可能在油酸的生物合成通路中发挥功能.[结论]通过iTRAQ分析了海分枝杆菌mkl突变株和野生株的差异表达蛋白谱,发现可能影响分枝杆菌油酸、脂质等合成代谢通路,为进一步研究mkl基因在分枝杆菌致病中发挥作用的相关机制奠定了基础.