倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性

• 作者: 俞瑜 李兵娟 许在恩 郭小勤 陈虹君
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 分子遗传学 倭竹族 竹类植物 14-3-3基因家族 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 页码范围: 80-87
• 页数: 8页
• 分类号: S795|Q75
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011

摘要

为研究倭竹族Shibataeeae中14-3-3非ε类基因的结构及其编码区单核苷酸多态性,分别从倭竹族5个不同属的代表种中获得14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e,14-3-3f的基因全长.这些基因均包含5个外显子和4个内含子,编码序列(CDS)大小为771～789 bp.14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e和14-3-3f编码区序列中分别有21,19,26和17个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率分别为1SNP/38 bp,1SNP/41 bp,1SNP/30 bp,1SNP/46 bp,基因核苷酸多样性(π)值分别为0.012 17,0.011 83,0.015 21,0.010 38.同一基因在不同竹种间氨基酸序列一致性均达99％以上,毛竹Phyllostachys edulis Pe 14-3-3b,Pe14-3-3c,Pe14-3-3e,Pe14-3-3f蛋白的理化性质非常相似,均为亲水性蛋白,含量较多的是丙氨酸(ala),谷氨酸(glu),亮氨酸(leu),等电点为4.75～4.90,这4个蛋白的二级结构也非常相似,α-螺旋结构含量最高,无规则卷曲其次,β-转角和延伸链很少.上述研究为进一步探索竹类植物14-3-3生物学功能奠定基础.