利用荧光标记SSR绘制中国芍药品种分子身份证

• 作者: 刘燕 刘爱青 张嘉 张淑玲 解莹然
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芍药 SSR荧光标记 分子身份证 品种鉴定
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 园艺学 Horticulture Sciences
• 页码范围: 101-109
• 页数: 9页
• 分类号: S682.1+2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13332/j.1000--1522.20150349

摘要

为了开发芍药品种分子鉴定方法,本研究采用SSR标记技术,在目前芍药SSR引物开发较少的情况下,采用文献相关引物84对,并结合自行设计的27对引物,将6%非变性聚丙烯酰胺凝胶与四重荧光毛细管电泳技术相结合,从111对引物中筛选出29对扩增稳定、多态性高的核心引物；共检测到223个SSR等位位点,平均每对引物为7.69个,有效等位基因数(Ne)为3.658±0.328,Shannon 多样性指数(I)为1.371±0.104,观测杂合度(Ho)为0.532±0.045,期望杂合度( He)为0.645±0.036,多态性信息含量PIC值介于0.20~0.84,平均0.60。基于最少引物鉴定最多种质的原则,按照PIC值由高到低顺序串联排序的方式,最终筛选出4对SSR引物( Pmg153、Knu73、Pmg209、J38)。结果表明：筛选出的4对SSR引物组合可以有效鉴定66个芍药品种；采用个位数字和大写英文字母结合对不同带型进行编码,成功绘制了66个中国传统芍药品种的分子身份证。本研究为芍药品种鉴定提供了一种快速、准确与高效的分子检测方法,也有助于中国传统芍药品种的遗传改良与芍药新品种保护。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘爱青		3	15	3.0	3.0