番茄中Rpi-blb2同源基因的挖掘与鉴定

• 作者: 刘红占 王俊生 王永立 胡利宗 陈龙
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 晚疫病 基因 垂直同源 进化分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 462-470
• 页数: 9页
• 分类号: Q943.2|S641.2
• 字数: 6906字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201408016

摘要

番茄晚疫病是番茄生产中的主要病害之一,经常会造成较大的经济损失.晚疫病生理小种的变异和进化常会导致番茄品种原有的遗传抗性丧失,因此不断挖掘新的抗性基因,改良番茄晚疫病抗性是番茄抗病育种的长期任务.该研究采用BLAST同源比对的方法,以马铃薯野生近缘种的晚疫病抗性蛋白序列Rpi-blb2为种子序列,在NCBI蛋白质序列数据库中检索得到11条番茄蛋白质序列,这些序列与种子序列相似性为78％～83％,属于番茄疾病抗性蛋白家族,并对该家族成员进行了基因结构、基因定位、序列保守结构域和进化关系等分析.结果表明:该家族中10条序列分布在第Ⅵ条染色体上,1条分布在第V染色体上;6号染色体上的10序列呈现2个抗病基因簇分布,在染色体上分别占据2个和3个基因位点;10条同源蛋白是Rpi-blb2的共同垂直同源蛋白,但不具有平行同源关系,大多数成员定位于细胞质.按照蛋白质保守结构域和基因定位的不同可分为三类,第一类共4条系列,包含有DUF3542和NB-ARC两个保守结构域特征序列;第二类共6条 序列,与马铃薯Rpi-blb2蛋白一样,仅包含NB-ARC保守结构域特征序列,在这2类蛋白序列的NB-ARC结构域均位于序列中部;第三类(仅包含XP_004239406.1)虽然也具有与第一类蛋白相似的DUF3542和NB-ARC结构域,但在结构域两端的非保守区序列较短,且位于5号染色体上,因此将其单独归为1类.前两类蛋白成员相应的基因具有1～2个内含子,第3类蛋白不含内含子.该研究结果为利用生物技术选育番茄抗性品种提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈龙	周口师范学院生命科学与农学学院	80	656	13.0	22.0
2	王永立	周口师范学院生命科学与农学学院	23	114	4.0	10.0
3	王俊生	周口师范学院生命科学与农学学院	30	48	4.0	5.0
4	刘红占	周口师范学院生命科学与农学学院	14	2	1.0	1.0
5	胡利宗	周口师范学院生命科学与农学学院	19	22	3.0	4.0