榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum中GGPP合酶基因的克隆与表达

• 作者: 刘洪伟 李艳艳 杨艳芳 王帅 邱德有
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 内生真菌 GGPP合酶 原核表达 基因克隆 紫杉醇
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 456-461,506
• 页数: 7页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 3828字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201410011

摘要

牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶是产紫杉醇内生真菌紫杉醇合成下游途径中的关键步骤之一,在榛子产紫杉醇内生真菌中进行紫杉醇生物合成研究时首先要确认GGPP合酶的存在.该研究通过RT-PCR方法克隆得到了榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum中GGPP合酶基因PaGGPPS(GenBank登录号为KM881430)的cDNA开放阅读框(Open reading frame,ORF).利用生物信息学方法,我们分析了该基因的序列,并对其编码的氨基酸序列进行了预测.结果发现该基因ORF长度为1 113 bp,预计蛋白分子量为40.98kD,等电点为6.168,表明该蛋白呈酸性.对其进行亲疏水性分析发现肽链整体呈现为亲水性.PaGGPPS的主要二级结构元件为α-螺旋,并且包含一个异戊二烯类化合物合酶功能域.对榛子产紫杉醇内生真菌与其他物种的GGPPS进行氨基酸同源性分析,发现其与娄地青霉、曲霉菌和费氏新萨托菌的一致性较高,分别为94％、76％和76％.进化树分析表明来自动物、真菌和酵母的GGPPS聚为一类,来自植物的GGPPS聚为一类,其中榛子产紫杉醇内生真菌的GGPPS和青霉菌的进化关系最近,与植物的GGPPS的进化关系最远.对其进行基础生物信息学分析后,我们构建了原核表达载体,成功诱导其表达并得到可溶性蛋白.该研究结果为下一步深入研究GGPPS基因在内生真菌Penicillium aurantiogriseum紫杉醇合成途径中的作用及和构建高产紫杉醇基因工程菌株奠定了一定的基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘洪伟	林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所	2	3	1.0	1.0
2	杨艳芳	林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所	2	3	1.0	1.0
3	李艳艳	林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所	1	3	1.0	1.0
4	王帅	林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所	1	3	1.0	1.0
5	邱德有	林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所	1	3	1.0	1.0