葡萄牙牡蛎外套膜转录组测序及壳色基因挖掘

• 作者: 严璐琪 宁岳 巫旗生 曾志南 王晓清 祁剑飞 郭香
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄牙牡蛎 壳色 转录组
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 畜牧?兽医?水产
• 页码范围: 409-414
• 页数: 6页
• 分类号: Q915.817|S917.4
• 字数: 3757字
• 语种: 中文

摘要

采用 Illumina 高通量测序平台对黑壳与金壳葡萄牙牡蛎(Crassostrea angulata)外套膜组织开展转录组测序研究，其中黑壳组总计产出5857718092 nt 数据，筛选后的干净阅读子58004560个；金壳组产出6727447326 nt数据，干净阅读子66614854个。将发掘的新基因与 COG、GO、KEGG、Swiss-Prot、NR 数据库进行序列比对，最终得到各数据库注释的新基因数量分别为147、397、203、567、1347个。通过对差异表达基因的序列进行生物学功能注释和聚类分析以及利用已知贝壳基质蛋白序列进行搜索，鉴定出14条可能与壳色表达有关的贝壳基质蛋白基因，其中5条下调基因可能与金壳基因表达相关。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王晓清	湖南农业大学动物科学技术学院	93	807	16.0	25.0
3	祁剑飞		10	38	4.0	6.0
4	宁岳		22	123	7.0	10.0
5	巫旗生		14	67	6.0	7.0
8	郭香		4	11	2.0	3.0
9	严璐琪	湖南农业大学动物科学技术学院	1	3	1.0	1.0