基于转录组学测序的长白落叶松材性表达基因1）

• 作者: 张含国 张磊 张素芳 王艳红 赵佳丽
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: 长白落叶松 转录组 高通量测序 材性基因
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 页码范围: 8-12
• 页数: 5页
• 分类号: S791.225
• 语种: 中文

摘要

基于边合成边测序（ Sequencing By Synthesis ，SBS）技术，使用Illumina HiSeq2500高通量测序平台对长白落叶松cDNA文库进行测序。共获得非重复序列基因58683条，总长度为55283938 bp。将得到的转录本使用BLAST软件将非重复序列基因序列与NR、Swiss－Prot、GO、COG、KEGG数据库比对，通过选择BLAST参数E－value不大于10－5，最终获得29350个有注释信息的基因序列，其中19292个转录本注释GO编号，有9112个转录本在COG数据库中被注释并分为25个功能分类，同时注释到120条KEGG代谢途径。在得到注释的转录本中搜索到木质素相关基因共68条，其中与木质素合成相关基因29条，与木质素分解代谢相关基因27条；找到了147条纤维素相关基因，其中与纤维素合成相关基因103条，与纤维素分解代谢相关基因44条。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张含国		14	88	6.0	8.0
2	张磊		6	28	3.0	5.0
3	赵佳丽		1	1	1.0	1.0
4	张素芳		1	1	1.0	1.0
5	王艳红		1	1	1.0	1.0