杨树磷酸肌醇特异性磷脂酶 C 基因家族鉴定与分析

• 作者: 丁莉萍 张杰伟 王宏芝 陈亚娟 魏建华
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 磷酸肌醇特异性磷脂酶 C 杨树 进化分析 基因家族
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 1181-1186
• 页数: 6页
• 分类号: Q945.78|S601
• 字数: 3044字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.11.008

摘要

为了对已测序杨树 Populus trichocarpa Torr.& Gray 中磷酸肌醇特异性磷脂酶 C (phosphoinositide-specific phospholipase C,PI-PLC)家族基因进行系统分析,利用杨树基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定杨树 PI-PLC 家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过蛋白序列比对进行进化和分类分析。结果表明,杨树中含有7个 PI-PLC 家族基因,含有8~10个外显子,分布于杨树的4条染色体上。MEME 和 Pfam 保守结构域分析显示,杨树 PI-PLC 蛋白均含有4个保守的 EF、X、Y 和 C2结构域。蛋白质进化树分析结果表明PI-PLC 可分为2个亚家族。