基因条码在条斑紫菜(Pyropia yezoensis)不同品系间种质鉴定中的适用性

• 作者: 严兴洪 曹殿嘉
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 条斑紫菜 基因条码 品系 种质鉴定
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 114-119
• 页数: 6页
• 分类号: Q949.29+2.1
• 字数: 3640字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11758/yykxjz.20150430002

摘要

为寻找适宜的条斑紫菜(Pyropia yezoensis)品系间种质分子标记鉴定法,利用4种基因条码(RUBISCO Spacer、UPA、Cox2-3和ITS-5.8S)对产自中国和日本的6个条斑紫菜品系的亲缘关系进行了分析研究.结果显示,在6个条斑紫菜品系中,上述4种基因条码的序列同源性较高,同源性为97.8％-100％,其中,RUBISCO Spacer序列的同源性为100％.UPA序列的同源性分析结果显示,在中国产的LS、B4、HT和TM18品系中,该序列完全相同,但与日本产的GT和ROS-2两个品系的序列有差异,该序列的同源性为99.2％.在6个品系中,Cox2-3和ITS-5.8S序列的同源性相对较低,分别为97.8％-99.2％和98.4％-99.8％.根据UPA、Cox2-3和ITS-5.8S基因条码通过邻接法构建的系统进化树显示,依据ITS-5.8S和UPA序列均能分别区分中国产的4个品系(LS、B4、HT和TM18)与日本产的两个品系(GT和ROS-2),分别形成两个大分支,其聚类结果与实际亲缘关系一致.但利用ITS-5.8S序列均能对中国产的4个品系和日本产的两个品系进行再区分,而利用UPA序列却无法对中国产的4个品系进行再区分,只能区分日本产的两个品系.使用Cox2-3序列则将GT、ROS-2、LS和TM18这4个品系聚成一个大分支,其聚类结果与实际亲缘关系不一致.上述结果说明,利用ITS-5.8S序列对本研究的6个条斑紫菜品系进行种质鉴定,效果最好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	严兴洪	上海海洋大学水产与生命学院	48	255	9.0	13.0
5	曹殿嘉	上海海洋大学水产与生命学院	1	0	0.0	0.0