杜鹃花EST-SSR标记的开发及遗传多样性分析

• 作者: 刘蓉 卢丹 吴月燕 明萌 李美芹 潘叶羽 谢晓鸿 钱萍仙 饶慧云
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 杜鹃花 EST-SSR PAGE 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 356-364
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2015.0691

摘要

从NCBI公共数据库下载2535条杜鹃花相关表达序列标签(expressed sequence tags, EST), SSR位点搜索共得到435个位点。利用Primer5.0对重复基元数较大的30个SSR位点设计引物,通过混合基因池进行引物初筛,25对引物可扩增出条带；利用非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)研究25对SSR引物的PCR扩增特点。14个SSR位点为多态性,各位点的等位基因介于2~5个,平均等位基因数3.8个；观望杂合度Ho、期望杂合度He、多态信息含量PIC范围分别为0~0.8333、0.0816~0.7172、0.0767~0.6471；多态位点中有5个高度多态、7个中度多态和2个低度多态。非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类分析结果表明：开发的14个EST-SSR标记能有效鉴定种质资源,对于杜鹃花品种的鉴定与遗传多样性分析具有重要应用价值。