利用转录组测序技术鉴定紫花苜蓿根系盐胁迫应答基因

• 作者: 郑钢 马进
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 紫花苜蓿 盐胁迫 转录组测序 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 1470-1479
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2016.08.1470

摘要

盐害是影响紫花苜蓿生产力的主要非生物因素之一,鉴定控制这一复杂性状的基因将为苜蓿育种计划提供关键信息.为揭示紫花苜蓿在盐胁迫下基因表达谱的变化,以紫花苜蓿Millennium为材料,对正常培养(WT_CK1)和盐胁迫(WT_N1)条件下的2个样品根系进行转录组分析,同时利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对部分关键基因的表达特点进行验证.结果表明,紫花苜蓿根系在250 mMNaCl胁迫72 h时,共检测到31 907个基因表达量发生了改变,2 758个基因的表达量差异达到2倍以上,包括199个转录因子,其中1 338个表达量上调,1 420个表达量下调,这些差异表达基因功能主要涉及次生代谢、代谢途径、激素代谢及信号转导和植物病原菌互作等.qRT-PCR分析表明,6个随机选择的基因在胁迫前后的表达特点与表达谱测序结果一致.综上,紫花苜蓿根系对盐胁迫响应是一个多基因参与、多个生物代谢过程反应协同调控的过程,基因表达量的变化可能是调控的主要方式.此外,本研究候选了一系列胆汁酸:Na+共转运蛋白、晚期胚胎发生富集蛋白、谷胱甘肽-s-转移酶基因和转录因子等与紫花苜蓿盐胁迫相关的应答关键基因,为揭示紫花苜蓿耐盐分子机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马进	浙江农林大学风景园林与建筑学院	29	162	8.0	11.0
2	郑钢	浙江农林大学风景园林与建筑学院	19	139	7.0	11.0