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干旱胁迫下香蕉幼苗蛋白质组学分析
干旱胁迫下香蕉幼苗蛋白质组学分析
作者:
冯斗
孙洁
庞昇泽
禤维言
原文服务方:
南方农业学报
香蕉
干旱胁迫
差异表达蛋白
iTRAQ
液相色谱—质谱联用(LC-MS-MS)技术
摘要:
[目的]研究干旱胁迫下香蕉蛋白表达情况,为探索香蕉的抗旱分子机制提供理论依据.[方法]以桂蕉1号组培苗叶片为材料,对其进行干旱胁迫处理,运用iTRAQ结合液相色谱—质谱联用(LC-MS-MS)技术对其差异蛋白进行检测,并通过生物信息学分析对香蕉叶片蛋白质组进行鉴定.[结果]从干旱胁迫处理的组培苗叶片中共鉴定出1655种蛋白,其中获得定量信息的蛋白有1023种,差异表达蛋白78种,包括上调蛋白32种和下调蛋白46种.GO生物进程分析结果表明,78种差异表达蛋白参与了细胞过程、代谢过程、响应刺激胁迫过程及单有机体过程等多个生物进程.GO分子功能分析结果表明,上调蛋白主要具有催化活性功能、结合功能、抗氧化活性和功能调节;下调蛋白主要具有催化活性功能和结合功能.GO富集分析结果显示,上调蛋白主要参与过氧化氢反应、活性氧反应等;下调蛋白主要参与淀粉代谢、二糖代谢、蔗糖代谢、寡糖代谢、细胞碳水化合物生物合成等多个碳素代谢进程,且其主要是质外体、胞外区、类囊体等部位的组分,参与1,6-二磷酸果糖1-磷酸酶反应、蔗糖磷酸酶反应及碳水化合物磷酸酶反应等.在氮素代谢过程中,参与甘氨酸代谢的丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)在线粒体中的含量明显下降,而参与活性氧代谢的过氧化氢酶(CAT)含量明显上升.[结论]干旱胁迫下香蕉的表达蛋白种类及数量发生明显变化,且其抗旱机制是多种蛋白质共同作用的结果,主要通过调节物质和能量代谢及应激活动来发挥作用.
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内容分析
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文献信息
篇名
干旱胁迫下香蕉幼苗蛋白质组学分析
来源期刊
南方农业学报
学科
关键词
香蕉
干旱胁迫
差异表达蛋白
iTRAQ
液相色谱—质谱联用(LC-MS-MS)技术
年,卷(期)
2016,(12)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子生物学
研究方向
页码范围
2020-2026
页数
7页
分类号
S668.1
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j:issn.2095-1191.2016.12.2020
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
冯斗
广西大学农学院
51
347
12.0
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2
禤维言
广西大学农学院
29
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8.0
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孙洁
广西大学农学院
3
3
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庞昇泽
广西大学农学院
2
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干旱胁迫
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iTRAQ
液相色谱—质谱联用(LC-MS-MS)技术
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
总下载数(次)
0
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