应用PCR-DGGE技术分析福州左海湖的细菌群落组成

• 作者: 刘兰英 吕新 李玥仁 林碧娇 陈丽华
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 左海湖 细菌群落组成 16SrRNA PCR-DGGE
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 资源与环境科学
• 页码范围: 986-992
• 页数: 7页
• 分类号: Q938.8|X172
• 字数: 5028字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.09.017

摘要

应用PCR-DGGE技术对4个月份（2011年12月、2012年2月、4月、6月)的福州左海湖细菌群落组成和优势菌群进行分析,研究结果发现相同月份4个采样点的 DGGE图谱差异性不大,细菌群落组成具有较高的相似性；而不同月份4个采样点的DGGE条带的数目和位置表现出明显差异,细菌群落组成差异明显。对20条不同位置的DGGE条带进行切胶回收、扩增和测序后,进行系统进化分析,结果显示这20条带归属于4个细菌类群,即变形菌门Proteobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes、放线菌门 Actinobacteria、蓝细菌门 Cyanobacteria。20条序列中有11条鉴定为变形细菌门 Proteobacteria、5条鉴定为拟杆菌门 Bacteroidetes、2条鉴定为放线菌门Actinobacteria、其余2条属于蓝细菌门 Cyanobacteria。研究结果表明,左海湖细菌群落组成包括了Proteobacteria、Bacteroidetes、Actinobacteria、Cyanobacteria,其中以Proteobacteria为优势菌群。