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皖南黄兔IGF1基因扩增及其多态性分析
皖南黄兔IGF1基因扩增及其多态性分析
作者:
吴东
杨普
杨永新
汪勇
汪善义
王小飞
程广龙
赵小伟
赵辉玲
黄冬维
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
皖南黄兔
IGF1基因
扩增
多态性
摘要:
胰岛素样生长因子1(IGF1)是动物生长发育等生命过程中的重要调节因子,目前关于家兔IGF1基因序列扩增和多态性的研究还很少。该研究以安徽皖南黄兔为试验动物,通过PCR方法扩增其IGF1基因编码区全序列,利用混合DNA池测序和生物信息学方法分析了IGF1基因扩增区域的遗传变异特性。结果获得皖南黄兔IGF1基因包含第1~5外显子的基因组序列5条,长度分别为316、657、691、757和403 bp,与种子序列一致性分别为100%、99.5%、99.9%、99.7%和99.8%;5个外显子组成432 bp的CDS序列,编码143个氨基酸残基组成的蛋白质。测序和生物信息学分析结果则表明,在皖南黄兔IGF1基因内含子1中存在3个多态位点(3056G>A、3107T>C和3164 G>A),3个位点并不位于剪接位点,但分别位于MZF1、ATF4、CEBPA、HLF和NKX2-8顺式作用元件位置,因而可能影响基因表达。该研究成功扩增获得皖南黄兔IGF1基因全部5个外显子序列,拼接获得基因编码区全序列,并利用混合DNA池测序法发现了内含子3个新的SNP位点,研究结果为揭示肉兔IGF1基因功能奠定了基础。
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文献信息
篇名
皖南黄兔IGF1基因扩增及其多态性分析
来源期刊
中国草食动物科学
学科
农学
关键词
皖南黄兔
IGF1基因
扩增
多态性
年,卷(期)
2016,(6)
所属期刊栏目
遗传育种
研究方向
页码范围
6-10
页数
5页
分类号
S829.2
字数
3361字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-3887.2016.06.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
程广龙
75
434
11.0
17.0
2
吴东
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474
12.0
17.0
3
杨普
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4
杨永新
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黄冬维
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赵小伟
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王小飞
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汪勇
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汪善义
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传播情况
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IGF1基因
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
中国草食动物科学
主办单位:
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
2095-3887
CN:
62-1206/Q
开本:
大16开
出版地:
甘肃省兰州市七里河区硷沟沿335号
邮发代号:
54-57
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
4918
总下载数(次)
2
总被引数(次)
18681
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