三角帆蚌短型肽聚糖识别蛋白S3基因克隆及表达分析

• 作者: 刘毅 吴圣楠 张建强 李海军 隗黎丽
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 肽聚糖识别蛋白 三角帆蚌 基因克隆 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 页码范围: 921-927
• 页数: 7页
• 分类号: Q344+.1
• 字数: 5493字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2016.119

摘要

肽聚糖识别蛋白(PGRPs)是机体先天免疫系统中的重要模式识别受体,研究对三角帆蚌的一种短型肽聚糖识别蛋白进行了克隆与表达分析.研究采用5'、3'RACE技术,对高通量转录组测序所得三角帆蚌PGRPS3基因(hcPGRPS3)片段分别进行了5',3'末端克隆,经拼接得到hcPGRPS3 cDNA全长序列.采用多种分子生物学软件对hcPGRPS3 cDNA全长序列进行了特征分析,实时荧光定量(qRT-PCR)检测了其组织分布,及经肽聚糖(Peptidoglycan,PGN)和脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)刺激后其在肝胰腺中的基因表达变化.hcPGRPS3 cDNA全长1438 bp,开放阅读框为858 bp,编码285个氨基酸,预测分子量大小为32.3 ku,pH 7.0时的理论等点为7.98.序列中不存在信号肽与跨膜结构.氨基酸序列保守性分析表明,其他物种短型PGRP中,以夏威夷短尾鱿PGRP4与hcPGRPS3同源性最高(51％).qRT-PCR检测结果显示,hcPGRPS3在性腺及肝胰腺中表达水平较高.经PGN或LPS刺激后,肝胰腺中hcPGRPS3表达水平显著上调,表明hcPGRPS3可能在机体抗菌免疫反应中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	隗黎丽	江西农业大学动物科学学院	34	170	8.0	11.0
2	刘毅	江西师范大学生命科学学院	16	49	5.0	6.0
3	张建强	江西师范大学生命科学学院	3	17	2.0	3.0
4	吴圣楠	江西师范大学生命科学学院	4	19	2.0	4.0
5	李海军	江西师范大学生命科学学院	3	12	2.0	3.0