has-miR-16靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 孙诗博 曾怀才 李武 潘小元 贺庆芝
• 来源期刊: 中华疾病控制杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 基因 计算生物学 预测
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 193-197
• 分类号: R349.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.02.022

摘要

目的 预测has-miR-16靶基因并对靶基因的分子功能、生物学过程和信号转导通路富集性分析,全面认识miR-16涉及的生命过程和疾病.方法 通过阅读文献结合生物信息学预测的方法得出靶基因集合,用Cytoscape 3.2.1软件和DAVID (the database for annnotation visualization and integrated discovery)数据库分别对靶基因GO(gene ontology)注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)信号转导通路进行富集性分析.结果 各物种已知的成熟miR-16序列具有高度保守性.397个靶基因在分子功能上显著富集于蛋白结合、DNA结合、酶类活性、胰岛素样生长因子受体活性等功能,在生物学过程显著富集于发育过程、细胞粘附、神经发生、细胞代谢和细胞周期调控等过程.靶基因显著富集的信号通路有癌症通路、p53信号通路、神经营养因子信号通路等通路.结论 从分析结果得出has-miR-16通过调控靶基因参与了人类生命活动和疾病过程的很多方面,尤其在癌症的病理过程是一个值得进一步研究的方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贺庆芝	南华大学药学与生物科学学院生物学系	47	150	7.0	9.0
2	曾怀才	南华大学公共卫生学院预防医学系	39	148	7.0	10.0
3	李武	南华大学公共卫生学院预防医学系	4	19	3.0	4.0
4	孙诗博	南华大学公共卫生学院预防医学系	2	14	2.0	2.0
5	潘小元	南华大学公共卫生学院预防医学系	4	19	3.0	4.0