利用50K芯片数据分析中国11个地方绵羊群体的遗传结构

• 作者: 张莉 朱才业 杜立新 王慧华 胡师金 袁泽湖 赵福平 魏彩虹
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绵羊 群体结构 网络视图(NETVIEW)
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 899-908
• 页数: 10页
• 分类号: S826|S813.3
• 字数: 5986字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.05.006

摘要

旨在构建我国绵羊群体遗传结构的精细图谱,为我国绵羊遗传资源的保存、利用提供依据.利用乌珠穆沁羊、湖羊、同羊、大尾寒羊、罗布羊、哈萨克羊、多浪羊、迪庆羊、青海臧羊、四川藏羊、西藏藏羊共计11个地方绵羊品种(资源)的Illumina Ovine SNP 50K 芯片数据,应用NETVIEW、PCA、STRUCTURE、NJ树等方法对群体结构进行分析.结果表明,乌珠穆沁羊与除罗布羊以外的蒙古系绵羊均有直接遗传关系,与罗布羊有间接的遗传关系.罗布羊与哈萨克系绵羊有较近的遗传关系,而哈萨克系的哈萨克羊与多浪羊存在较远的遗传关系.迪庆羊能够与藏系绵羊分离开,西藏地区藏羊能够与其他地区的藏羊分开,青海、四川的藏羊不能分开.结果提示,NETVIEW计算时间短,且基本能够反映史实,因而可以作为未来群体结构分析的工具;乌珠穆沁羊是此次试验选用的蒙古系绵羊中最古老的品种;蒙古系的罗布羊因混有哈萨克系绵羊的血统而与新疆地区的绵羊聚在一起;不同地区的藏羊存在着分化趋势,但分化并不严重.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜立新	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	110	1652	21.0	37.0
2	张莉	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	190	1101	14.0	26.0
3	赵福平	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	9	31	3.0	5.0
4	袁泽湖	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	2	12	1.0	2.0
5	朱才业	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	3	19	2.0	3.0
6	王慧华	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	5	14	2.0	3.0
7	胡师金	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	1	11	1.0	1.0