2013年中国典型对虾养殖区白斑综合征病毒流行株高变异区序列的分析比较

• 作者: 万晓媛 刘庆慧 孙新颖 黄倢
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: WSSV ORF 缺失 变异 PCR
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 693-703
• 页数: 11页
• 分类号: S945
• 字数: 5101字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2016.15368

摘要

为了解中国不同地区白斑综合征病毒的流行变异情况,本研究取用2013年3—12月从7个省市发病地区采集到的64份WSSV阳性样本,以特异的引物扩增目的片段,通过测序分析不同样本的缺失及变异差异。结果显示,在开放阅读框ORF14/15的扩增中,分别有6530 bp、6533 bp和5138 bp的片段缺失,而在ORF23/24扩增中有12070 bp大片段的缺失,不同地区样本中未能成功扩增ORF75,而ORF94的重复单元数目分别为0、3、4、12不等, ORF125的重复单元数目为0、7。SNP分析表明,含有3个重复单元的ORF94在48位的碱基为T、T、T,重复单元数为4的在48位的碱基为T、T、T、T,重复单元数为12的在48位的碱基分别为T及11个A。而ORF125所有重复单元数为7的情况在8、18、25、66、69位置的碱基均为G、G、G、G、A,在9、50、53、61位的碱基也普遍出现了变异。结果表明, WSSV在中国不同地区存在一定程度的变异,其在序列中的缺失、重复单元数目以及SNP的差异较为明显。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	万晓媛	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	3	12	2.0	3.0
2	孙新颖	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	2	19	2.0	2.0
6	刘庆慧	农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所	16	108	6.0	9.0