系统性鉴定长非编码RNA MALAT1调控的微小RNA

• 作者: 尹荣 张海天 王国祥 许林 邱满堂
• 来源期刊: 中国肺癌杂志
• 关键词: 长非编码RNA MALAT1 microRNA 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 247-251
• 页数: 5页
• 字数: 2096字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3779/j.issn.1009-3419.2016.05.11

摘要

背景与目的长非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）在肿瘤的发生、侵袭转移等过程中发挥着重要的调控作用。本研究通过实验和生物信息学手段系统性研究lncRNA MALAT1调控的微小RNA（microRNA, miRNA）。方法设计特异性敲减MALAT1的反义寡核苷酸（antisense oligonucleotides, ASO），在A549细胞中敲减MALAT1，通过TqaMan Low Density Array（TLDA）芯片研究敲减MALAT1后miRNA表达变化；使用基因集富集分析（gene set enrichment analysis, GSEA）方法分析敲减MALAT1之后差异表达基因，寻找富集的miRNA。结果 ASO有效降低了MALAT1表达，敲减MALAT1之后153个miRNA表达显著变化，其中131个miRNA表达上调，22个miRNA表达下调。在A549细胞中敲减MALAT1后，458个基因发生显著差异表达，GSEA分析发现多个miRNA在差异表达基因中被显著富集。对TLDA和GSEA数据取交集并进一步分析确认28个被MALAT1调控的miRNA。结论本研究系统鉴定了MALAT1对miRNA的调控，为进一步研究提供了基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张海天	徐州医科大学临床医学系	3	0	0.0	0.0
2	王国祥	徐州医科大学附属医院心胸外科	7	3	1.0	1.0