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北京地区市售牡蛎轮状病毒污染调查
北京地区市售牡蛎轮状病毒污染调查
作者:
严寒秋
刘白薇
李丹地
王全意
钱海坤
陈丽娟
霍达
高志勇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
牡蛎
A组轮状病毒
半巢式RT-PCR
基因型
摘要:
目的:调查北京地区市售牡蛎轮状病毒的污染状况。方法2014年2月至2015年3月,在北京市某大型水产品批发市场采集,每摊位采5只为一组,共56组280只牡蛎。用3种方法对样品前处理:直接处理法、PEG 8000沉淀法和蛋白酶K消化-PEG 8000沉淀法。然后利用荧光RT-PCR检测样品的A组轮状病毒核酸,采用半巢式反转录-聚合酶链反应方法对A组轮状病毒核酸阳性进行G、P基因分型。对阳性毒株的VP7和VP4基因进行扩增和测序,采用Mega 6.06软件构建进化树,建树方法为最大似然法。结果直接处理法、PEG 8000沉淀法和蛋白酶K消化-PEG 8000沉淀法3种前处理方法A组轮状病毒检出率分别为3.57%(2/56)、7.14%(4/56)和5.38%(3/56)。56组样品中8组A组轮状病毒核酸检测阳性,检出率为14.29%,均在秋冬季检出。轮状病毒基因型组合型为G9/P[8](2株)和G9/P[N](6株)。3株轮状病毒VP7基因和1株轮状病毒VP4基因成功测序,进化分析显示与近年来我国流行的G9/P[8]型毒株同源性最高。结论北京地区秋冬季市售部分牡蛎存在轮状病毒污染,有引起食源性疾病的风险。
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篇名
北京地区市售牡蛎轮状病毒污染调查
来源期刊
中华实验和临床病毒学杂志
学科
关键词
牡蛎
A组轮状病毒
半巢式RT-PCR
基因型
年,卷(期)
2016,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
41-44
页数
4页
分类号
字数
3190字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2016.01.011
五维指标
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牡蛎
A组轮状病毒
半巢式RT-PCR
基因型
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华实验和临床病毒学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1003-9279
CN:
11-2866/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区迎新街100号126室
邮发代号:
18-224
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
3761
总下载数(次)
8
总被引数(次)
19683
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