基于序列模式挖掘的基因剪接位点

• 作者: 孙永山 李旦 汤振宇 赵海峰 陈荣 马猛
• 来源期刊: 数据采集与处理
• 学科: 工学
• 关键词: 剪接位点 序列模式 最大信息熵模型 致病突变
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 页码范围: 1010-1019
• 页数: 10页
• 分类号: TP391
• 字数: 5503字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16337/j.1004-9037.2016.05.019

摘要

剪接是基因表达过程中连接转录和翻译的中枢步骤，是一个高度调控的过程。剪接位点是基因剪接过程中的核心调控元件。本文通过挖掘剪接位点序列中蕴含的序列特征，提出了一个基于序列模式挖掘的基因剪接位点序列打分模型。通过该模型，实现对剪接位点序列信号强度的定量度量。实验结果表明，该模型可有效分类真假剪接位点序列，分类效果优于最大信息熵模型，模型具有良好的鲁棒性，并且可有效识别致病剪接位点序列突变。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵海峰	安徽大学计算机科学技术学院	36	308	8.0	16.0
2	孙永山	安徽大学计算机科学技术学院	1	5	1.0	1.0
3	汤振宇	安徽大学计算机科学技术学院	2	7	2.0	2.0