斑点叉尾(鲴)GHRH基因3个SNPs位点及其单倍型组合与生长性状的关联分析

• 作者: 张世勇 潘建林 王明华 秦钦 边文冀 钟立强 陈校辉
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑点叉尾(鲴) GHRH SNP SNaPshot 生长性状 单倍型分析 关联分析
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 页码范围: 886-893
• 页数: 8页
• 分类号: Q953
• 字数: 5784字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2016.114

摘要

研究旨在探讨生长激素释放激素基因(Growth hormone-releasing hormone,GHRH)对斑点叉尾(鲴)(Ictalurus punctatus)生长性状的影响.采用DNA混池测序法筛选GHRH基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,使用SNaPshot法将筛选到的SNPs多态性位点进行分型,并对这些位点进行连锁不平衡和单倍型分析.结果表明,在GHR基因内含子区域共检测到4个SNPs位点,并成功地对3个位点进行了分型,3个位点间均不存在强连锁不平衡;3个SNPs位点在176尾斑点叉尾(鲴)中形成了6种有效单倍型.关联分析表明SNP位点g.6301 G＞A的AA基因型的体质量显著性地高于AG和GG型(P＜0.05),比群体的平均体质量高14％.单倍型组合H1/H4和H1/H5个体的体质量和体长极显著性地高于其他单倍型组合(P＜0.01),体质量比群体平均体质量分别高30％和15％,体长比群体平均体长分别高7％和6％.研究为斑点叉尾(鲴)生长性状分子标记辅助选育和QTL定位提供了参考依据.