糙皮侧耳原基期差异表达基因分析

• 作者: 张倩 戚元成 申进文 薛元 邱立友
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 糙皮侧耳 抑制性消减杂交cDNA文库 异表达基因 反向Northern blot 半定量RT-PCR
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1357-1364
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.150214

摘要

为解析糙皮侧耳原基期与菌丝期差异表达的基因,本研究以原基期cDNA为检测子(tester)、双核菌丝期cDNA为驱赶子(driver),采用抑制性消减杂交法(suppression subtractive hybridization,SSH)构建了糙皮侧耳SSH cDNA文库.菌液PCR验证SSH cDNA文库插入cDNA片段后,挑取了2 055个差异转化子,差异转化子经3次反向Northern杂交筛选,得423个信号差异显著的克隆;阳性克隆测序后,经NCBI数据库Blastn和Blastx比对,共得206条差异表达序列(expressedsequence tag,EST),重复序列去除后,有46个基因参与了细胞急救和防御、能量代谢、转录和蛋白调控、膜蛋白和信号转导,18个基因编码未知功能的推定蛋白,5个无任何同源性的新基因.挑取10个差异表达基因进行半定量RT-PCR,发现这些序列在原基期的表达水平显著高于菌丝期.结果表明,本研究成功构建了糙皮侧耳原基期与菌丝期SSH cDNA文库,为进一步分离糙皮侧耳生长发育相关基因并研究糙皮侧耳的发育机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	申进文	河南农业大学生命科学学院	85	534	12.0	18.0
2	邱立友	河南农业大学生命科学学院	89	983	20.0	27.0
3	戚元成	河南农业大学生命科学学院	64	533	11.0	20.0
4	张倩	河南农业大学生命科学学院	20	70	4.0	8.0
5	薛元	河南农业大学生命科学学院	6	43	3.0	6.0