牦牛星状病毒的RT-PCR检测方法的建立和变异分析

• 作者: 周芳 宋志刚 岳华 张斌 汤承 陈曦
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 星状病毒 RT-PCR ORF2基因 遗传变异
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1287-1292
• 页数: 6页
• 分类号: S852.653
• 字数: 4032字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.06.027

摘要

近期作者实验室从腹泻牦牛粪便样本中鉴定出一种新型星状病毒(AstV)—牦牛AstV,本研究旨在建立检测牦牛AstV的RT-PCR方法.首先设计引物扩增牦牛AstV 630 bp的ORF2基因片段,进行序列分析;在此基础上设计检测引物,建立检测牦牛AstV的RT-PCR方法.结果显示,从20份牦牛腹泻粪便中扩增出13个牦牛AstV ORF2基因片段,核苷酸相似性为99.3％～100％,而与牛肠源星状病毒(BAstV) ORF2基因的相似性仅为59.5％～80.8％;所建立的RT-PCR方法只扩增牦牛AstV的特异片段,对BAstV和其他无关病原无扩增;对病毒核酸的最低检测限为57.3fg·μL 1;比较试验表明,所建立的RT-PCR方法对牦牛AstV的检出率明显优于现有检测BAstV的RT-PCR方法.其对牦牛腹泻与健康粪便样本中牦牛AstV的检出率分别为55.5％(76/137)和7.7％(2/26)(P＜0.01).试验结果表明,扩增的ORF2基因片段的核苷酸序列在牦牛AstV毒株间高度保守,但相对于BAstV变异大;基于该序列建立的检测牦牛AstV的RT-PCR方法特异性好,灵敏度高,稳定性好,为牦牛AstV的检测和流行病学调查提供了有力工具;同时,本试验结果也提示牦牛AstV与犊牦牛腹泻有联系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	岳华	西南民族大学生命科学与技术学院	187	1071	15.0	23.0
2	汤承	西南民族大学生命科学与技术学院	194	1150	15.0	24.0
3	张斌	西南民族大学生命科学与技术学院	44	166	8.0	10.0
4	陈曦	西南民族大学生命科学与技术学院	12	48	4.0	6.0
5	宋志刚	西南民族大学生命科学与技术学院	1	4	1.0	1.0
6	周芳	西南民族大学生命科学与技术学院	5	21	3.0	4.0