三个绵羊群体MC4R基因多态性及生物信息学分析

• 作者: 刘娇娇 马友记
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 绵羊 黑素皮质素受体-4 多态性 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 87-93
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.04.011

摘要

旨在探讨绵羊黑素皮质素受体-4（melanocortin-4 receptor，MC4R）的分子机理，采用PCR-SSCP方法对3个绵羊群体（甘肃肉用绵羊新品种群、小尾寒羊和湖羊）的MC4R基因外显子进行多态性检测和生物信息学分析。结果表明，3个绵羊群体均存在3种基因型AA型、AB型和BB型，优势基因型为BB，其中优势等位基因为B；测序结果表明，野生型BB型和突变型AB型相比，AB型个体在该基因编码区第511位点发生G→A突变，第495位发生C→T突变；AA型个体在该基因编码区第511位点发生G→A突变，出现AA的纯合，第495位发生C→T突变，出现CC纯合；3个绵羊群体中小尾寒羊的多态信息含量属于中度多态（0.25<PIC<0.50），甘肃肉用绵羊新品种群羊和湖羊属于低度多态（PIC<0.25）；χ2适合性检验表明除湖羊之外，其余2个绵羊品种均处于Hardy-Weinberg平衡状态。生物信息学分析发现MC4R氨基酸序列有明显的疏水性区域，有7个跨膜螺旋区及信号肽，其编码蛋白主要的二级结构元件是α螺旋和无规则卷曲；同源性比对发现绵羊MC4R基因与山羊、牛、野猪、人类及大猩猩的相似度分别为97%、94%、81%、83%及83%，说明MC4R是一个非常保守的蛋白，在绵羊的生长发育中起着重要作用。