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摘要:
采用 PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对烟台黑猪 SLA-DQA 基因多态性进行研究,预测其蛋白质结构并分析其功能特征。结果显示:SLA-DQA 基因 exon 2、exon 3、exon 4分别检测出4种等位基因,5种基因型、6种等位基因,8种基因型、4种等位基因,7种基因型,包括3种新等位基因。SLA-DQA 基因共编码255个氨基酸,编码区共发现32个核苷酸突变和13个氨基酸变异,exon 2多态性最为丰富。蛋白质结构预测结果显示二级结构中无规则卷曲和延伸链比例最高,α螺旋数量多且集中,β折叠最少。功能预测结果显示,SLA-DQA 基因蛋白质在能量代谢、结构蛋白和生长因子等方面几率较高。本研究结果可为 SLA-DQA 基因在猪抗病分子育种中的应用提供理论依据。
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文献信息
篇名 烟台黑猪 SLA-DQA 基因编码区多态性及生物信息学分析
来源期刊 华北农学报 学科 农学
关键词 烟台黑猪 SLA-DQA 基因 编码区 多态性 蛋白质结构
年,卷(期) 2016,(5) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 86-93
页数 8页 分类号 S828|Q78
字数 6328字 语种 中文
DOI 10.7668/hbnxb.2016.05.013
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 滚双宝 甘肃农业大学动物科学技术学院 82 391 12.0 15.0
5 马艳萍 甘肃农业大学动物科学技术学院 8 26 3.0 5.0
6 黄晓宇 甘肃农业大学动物科学技术学院 5 2 1.0 1.0
7 杨巧丽 甘肃农业大学动物科学技术学院 15 74 5.0 8.0
8 袁军虎 2 2 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
烟台黑猪
SLA-DQA 基因
编码区
多态性
蛋白质结构
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
华北农学报
双月刊
1000-7091
13-1101/S
大16开
石家庄市和平西路598号
18-10
1986
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
总被引数(次)
88357
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