藏羚羊基因组微卫星分析与初步验证

• 作者: 周智红 徐永涛 谭春敏 郭松长 都玉蓉 马建滨
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 藏羚羊 基因组 微卫星 多态性
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 基础资料
• 页码范围: 845-851
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.8
• 字数: 4751字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11984/j.issn.1000-7083.20160213

摘要

为明确藏羚羊Pantholops hodgsoni核DNA中微卫星分布情况和特征,利用MISA工具对藏羚羊基因组进行微卫星扫描.在全长2696.89 Mb的藏羚羊基因组中,搜索到723135个微卫星座位,其中完全型微卫星有675809个.6种重复类型中,单核苷酸重复最多,有471142个,占69.72％;其次是二核苷酸、三核苷酸,分别为88832个和86658个,占13.14％和12.82％;六核苷酸最少,仅215个,约占0.03％.以藏羚羊基因组DNA为模板对微卫星座位进行验证,在100个微卫星座位中筛选到8个具有多态性的微卫星座位,多态比例约为8％.本研究将为研究藏羚羊微卫星标记、群体遗传多样性、藏羚羊保护生物学提供基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭松长	中国科学院高原生物适应与进化重点实验室	10	116	5.0	10.0
2	都玉蓉	青海师范大学生命与地理科学学院	26	110	6.0	9.0
4	马建滨	青海师范大学生命与地理科学学院	26	98	6.0	8.0
8	谭春敏		2	3	1.0	1.0
9	周智红	青海师范大学生命与地理科学学院	5	12	2.0	3.0
10	徐永涛	青海师范大学生命与地理科学学院	5	12	2.0	3.0