野生小豆和栽培小豆microRNA全基因组鉴定与比较分析

• 作者: 万平 李奕松 李永强 李江 杨凯 赵波 陈春海 马燕明
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: miRNA 栽培小豆(Vigna angularis) 野生小豆(Vigna angularis var.nipponensis)
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种?种质资源?分子遗传学
• 页码范围: 1273-1281
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2016.01273

摘要

MicroRNA (miRNA)是一种非编码的小RNA分子,对真核生物基因表达起着非常重要的调控作用, miRNA系统鉴定对于研究其功能及作用机制具有重要意义。本研究分别以栽培小豆京农6号(JN6)和野生小豆CWA108为试验材料,进行了深度miRNA测序。系统鉴定和注释这2个物种的miRNA,并分析了其miRNA种类的异同、表达量的差异和靶基因在功能富集上的差别。鉴定出了 JN6和 CWA108共有和特有的 miRNA,明确了它们之间差异表达的miRNA,以及这些特有和差异miRNA的靶基因在功能富集上的差异,发现可能和抗病与抗逆途径相关。