苏云金芽胞杆菌转录调控因子CodY的体外靶基因的筛选

• 作者: 李明顺 梅菲 齐明霞
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: CodY 靶基因 Avi-tag技术 苏云金芽胞杆菌 生物素 调控
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1178-1185
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20150477

摘要

[目的]利用Avi-tag和Pull down技术建立体外靶基因筛选的新方法,在苏云金芽胞杆菌YBT-1520基因组范围内进行体外高通量筛选转录调控因子CodY的靶基因,为深入研究CodY在苏云金芽胞杆菌中的功能及调控网络打下基础.[方法]用Avi-tag技术对CodY蛋白进行体外生物素标记,酶切苏云金芽胞杆菌YBT-1520总DNA并在两端加上便于测序的adapter序列,用链霉亲和素树脂筛选与CodY蛋白相互作用的靶基因.[结果]在苏云金芽胞杆菌中得到了46条CodY可以直接作用的靶序列,分析发现CodY在苏云金芽胞杆菌中主要调控氨基酸代谢、糖代谢、脂肪酸代谢、转运、调控、DNA修复、双组份调控等的转录.[结论]本研究采用的Avi-tag技术具有特异性强、操作简单、成本低等优势,为转录因子体外靶序列的高通量筛选提供新的方法;苏云金芽胞杆菌中CodY靶基因的筛选为其他微生物中CodY的功能研究打下基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李明顺	华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室	6	16	3.0	4.0
2	梅菲	华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室	2	3	1.0	1.0
3	齐明霞	华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室	1	0	0.0	0.0