基于高通量测序对宜宾芽菜中细菌群落结构分析

• 作者: 傅彬 叶碧霞 左勇 杨小龙 江鹏 王小龙
• 来源期刊: 食品工业科技
• 学科: 工学
• 关键词: 宜宾芽菜 细菌群落 高通量测序 Miseq
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 242-245,250
• 分类号: TS264.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2016.10.040

摘要

目的:研究宜宾芽菜发酵过程中细菌微生物多样性.方法:采用Illumina高通量测序技术对芽菜样本中所有细菌的16S V1-V3区进行测序,应用QIIME软件和Mothur软件分析和统计样品序列数目、OUT数量,并进行聚类分析.结果:宜宾芽菜发酵过程中6个阶段的样本共获得204997条有效序列,优化后有效序列数为41703条,共9202个OTU分类;主要细菌类群为Firmicutes(厚壁菌门)下的Bacillus(芽孢杆菌属),Bacteroidetes(拟杆菌门)下的Flavobacteriaceae (黄杆菌属)和Sphingobacterium(鞘脂杆菌属),Proteobacteria(变形菌门)下的Sphingomonas(鞘脂单孢菌属)、Acidovorax (嗜酸菌属)、Chromohalobacter(色盐杆菌属)和Pseudomonas(假单胞菌属)以及Actinobacteria(放线菌门)下的Arthrobacter(节杆菌属).结论:宜宾芽菜发酵过程中细菌菌群处于动态变化中,随着发酵的进行,部分细菌逐渐减少或消失,优势细菌趋于稳定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	左勇	四川理工学院生物工程学院	107	566	12.0	18.0
2	叶碧霞	四川理工学院生物工程学院	21	60	5.0	6.0
3	江鹏	四川理工学院生物工程学院	16	81	6.0	8.0
4	王小龙	四川理工学院生物工程学院	16	96	6.0	9.0
5	傅彬	四川理工学院生物工程学院	18	56	5.0	6.0
6	杨小龙	四川理工学院生物工程学院	18	57	5.0	6.0