利用转录组测序方法研究獭兔毛色相关基因

• 作者: 任克良 冯国亮 曹亮 李燕平 牛晓艳 郑建婷 黄淑芳
• 来源期刊: 中国草食动物科学
• 学科: 农学
• 关键词: 转录组测序 獭兔 毛色 差异表达 GO和KEGG通路分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S829.2
• 字数: 4470字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-3887.2016.02.001

摘要

利用转录组测序方法分析了不同毛色(白色和海狸色)獭兔皮肤组织中基因的表达差异,旨在找到影响獭兔毛色的候选基因.采用Illumina HiSeqTM2500测序平台对不同毛色獭兔耳组织中所有mRNA进行高通量测序,所得序列经质控、组装后比对到GO、COG、SWISS-PROT数据库中注释,并进行差异表达基因聚类分析和KEGG通路分析.结果表明:测序共获得Unigene 275 625个,差异表达基因12 408个,其中上调表达基因4 904个,下调表达基因7 504个.KEGG通路分析发现,这些差异基因显著地富集在13个代谢通路中,并在细胞色素代谢通路(metabolism of xenobiotics bycytochrome P450)中有8个差异表达的基因,其中CP2F1和CP2BB属于细胞色素P450家族成员,而GSTA4与黑素细胞分化有关,可能在獭兔毛色中发挥作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任克良	山西省农业科学院畜牧兽医研究所	91	293	9.0	14.0
2	李燕平	山西省农业科学院畜牧兽医研究所	57	173	8.0	11.0
3	黄淑芳	山西省农业科学院畜牧兽医研究所	28	69	5.0	7.0
4	牛晓艳	山西省农业科学院畜牧兽医研究所	26	48	5.0	6.0
5	曹亮	山西省农业科学院畜牧兽医研究所	46	91	6.0	7.0
6	郑建婷	山西省农业科学院畜牧兽医研究所	27	62	5.0	6.0
7	冯国亮	山西省农业科学院畜牧兽医研究所	19	33	4.0	5.0