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目的:探讨BM P9对间充质干细胞成骨分化的调控作用,通过系统的生物信息学分析研究BM P9诱导间充质干细胞成骨分化的分子调控网路。方法从GEO 数据库获取在BM P9促进间充质干细胞成骨分化过程中表达上调或下调的基因。然后应用DAVID和GeneMANIA数据库分析这些基因与BMP9及相互之间的关系。结果通过DAVID数据库分析,这些上调或下调的基因被富集到不同的生物学过程的基因子集如“软骨发育”子集和“血管发育和骨骼系统发育”子集。这些基因也可以被富集到不同的信号通路如 NOTCH 和 TGFbeta 信号通路,其中 MEF2C、DLX2、NOG、FGFR3、MSX1、KLF10、TIPARP、PT H1R、PTN和GAS1这10个基因被富集到“骨骼系统发育”这一子集。通过GeneM ANIA数据库分析,建立了这10个基因和BM P9及一些预测的基因的分子网络图,显示这些基因存在直接或间接的相互作用。结论 B M P9在调控间充质干细胞成骨分化过程中与许多基因如 MEF2C、DLX2、NOG、FGFR3、MSX1、KLF10、TIPARP、PT H1R、PT N和GAS1等存在相互作用,在研究BM P9调控间充质细胞成骨分化的分子调控机制时需要关注这些基因形成的调控网络。
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文献信息
篇名 BMP9调控间充质干细胞成骨分化的分子网络:生物信息学分析
来源期刊 山东医学高等专科学校学报 学科 医学
关键词 BM P9 间充质干细胞 成骨分化 生物信息学分析
年,卷(期) 2016,(6) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 448-452
页数 5页 分类号 R331.2
字数 3988字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-0947.2016.06.015
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1 蒋沂峰 9 20 3.0 3.0
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BM P9
间充质干细胞
成骨分化
生物信息学分析
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期刊影响力
山东医学高等专科学校学报
双月刊
1674-0947
37-1451/R
大16开
山东省临沂市聚才六路
1979
chi
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