中华大蟾蜍γ-肌动蛋白基因 Bbgγ-Actin 的克隆与生物信息学分析

• 作者: 代英辉 凌鸿 刘东春 刘彦芳 王东 王秋爽
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 中华大蟾蜍 γ-肌动蛋白 cDNA 全长 系统进化
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 156-164
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.09.021

摘要

旨在获得中华大蟾蜍肌动蛋白序列全长。以中华大蟾蜍（Bufo bufo gargarizans）耳后腺为材料，提取总 RNA，通过转录组高通量测序快速得到中华大蟾蜍肌动蛋白基因（BbgActin）cDNA 全长2055 bp，通过 RT-PCR 技术对其 ORF 序列进行验证，并对 BbgActin 基因进行分析。序列分析表明，BbgActin 基因开放阅读框长1131 bp，编码376个氨基酸。通过 BLAST P 程序分析，所得序列与 GenBank 数据库中肌动蛋白基因序列相似度均在89%以上，氨基酸序列的相似性达90%以上。系统进化分析表明， BbgActin 与γ-Actin 聚为一类，所得中华大蟾蜍肌动蛋白属于γ-Actin。首次获得了中华大蟾蜍γ-Actin cDNA 全长序列。