绵羊肺炎支原体贵州株P113基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 吴燕 周碧君 岳筠 文明 王琦 程振涛 袁海文
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绵羊肺炎支原体 P113基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 317-327
• 页数: 11页
• 分类号: S852.62
• 字数: 7001字
• 语种: 中文

摘要

为获得绵羊肺炎支原体贵州株P113基因生物信息学特征,应用DNAStar、Mega 5.0、Protparam、Protscale、IEBD等工具对其(GZ-QX1株)P113蛋白特性、结构和功能进行预测分析.结果显示,绵羊肺炎支原体GZ-QX1株P113基因序列大小为3 240 bp,编码1079个氨基酸,与绵羊肺炎支原体Y98标准株、四川SC01株、猪肺炎支原体P97、丝状支原体山羊亚种、山羊支原体山羊亚种的核苷酸序列同源性分别为99.9％、81.9％、60.4％、3.9％和5.2％.P113蛋白是分子质量约119 ku的碱性蛋白,具有较多优势抗原表位;蛋白结构分析显示,P113蛋白无跨膜结构,有9个N糖基化位点,59个丝氨酸、16个苏氨酸的磷酸化位点,14种保守的特异性蛋白质激酶的结合位点;蛋白功能分析认为,P113可能是某信号传导通路的信号分子,也是一种具有良好抗原性的结构蛋白.