陆地棉 NF-YB 基因家族的全基因组分析

• 作者: 刘静 张保龙 徐珍珍 杜建厂 袁娜 郭月
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: NF-YB 基因家族 陆地棉 生物信息
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 页码范围: 21-27
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|S562.03
• 字数: 4099字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2016.05.004

摘要

为了进一步了解 NF-YB 基因家族结构的功能，利用生物信息学手段，系统研究了陆地棉标准系 TM-1基因组中 NF-YB 基因家族的数目、亚细胞定位、染色体分布、进化关系、基序以及组织表达情况。结果表明：TM-1基因组中共有41个 NF-YB 基因家族成员，它们含有相同的 CBFD＿NFYB＿HMF 结构域，大部分定位到细胞核内；41个NF-YB基因家族成员分布在19条染色体上，其中有19组成员在 A 亚组和 D 亚组中表现为直系同源基因；进化树分为Ⅰ和Ⅱ2个小组，每个小组成员间具有相似的基序类型和排列顺序；组织表达分析则发现，在这41个 NF-YB 基因家族成员中，至少有24个成员可以进行表达，且表现出一定的组织特异性。